轄境原屬伊金霍洛旗、東勝區，2000年12月经批准成立自治区级的青春山开发区。2003年，内蒙古自治区同意将青春山开发区行政区域由伊金霍洛旗调整划归东胜区；同年6月，鄂尔多斯市一届四次人代会审议通过市政府迁址青春山开发区的决议。2004年5月市人民政府批准了控制性详细规划，并更名为康巴什新区，为开发区。
2006年，新区城市规划作为鄂尔多斯市城市总体规划的重要部分，获自治区政府批准，同年7月市府整体搬迁新区。经过规划、论证、审批等前期工作之后，新区正式启动建设，主要分三个阶段：2004年至2007年，基础设施建设阶段；2007年至2011年，地上项目建设阶段；2011年至2015年，项目建设完善阶段。2016年，国务院同意批准设立县级康巴什区，屬鄂爾多斯市市轄區，与原康巴什新区行政区划相同。